Dr Mukhlis Kamal, dosen IPB University yang juga Ketua Program Studi S2 Sumberdaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan (FPIK) mengatakan bahwa masih ada ikan asli Sungai Ciliwung yang tersisa. Yakni ikan beunteur, ikan genggehek, ikan baung, ikan bogo, ikan julung-julung, ikan uceng, dan lainnya. Ikan tor yang merupakan ikan yang hampir habis tetapi saat ini sudah mulai muncul di kawasan hulu Ciliwung. Namun kembali terancam dengan adanya pembangunan bendungan di Ciawi.